Синий архив 2 серия

Действие происходит в Кивотосе — городе, состоящем из множества академий, управляемых Генеральным студенческим советом. Президент совета исчезает, после чего в городе начинаются беспорядки. Совет обращается за помощью в Федеральное бюро расследований S.C.H.A.L.E., созданное президентом незадолго до исчезновения. Главный герой — Сэнсэй, таинственный учитель, прибывший в город по приглашению президента. Он становится главой S.C.H.A.L.E. и получает первое задание.

Задание заключается в помощи ученикам академии Абидос, чья школа находится под угрозой закрытия. Сэнсэю и ученикам предстоит преодолеть трудности, чтобы спасти академию. В процессе они также пытаются раскрыть тайны, связанные с городом Кивотос и исчезновением президента студенческого совета.