Аниматрица

Эпизод «Последний полёт "Осириса"» рассказывает о команде исследовательского корабля «Осирис». Они обнаруживают армию вторжения. Один из членов экипажа проникает в Матрицу, чтобы доставить предупреждение. Остальные пытаются дать ему время, сражаясь с роботами-стражами. Эпизоды «Второе возрождение» описывают создание людьми идеального искусственного интеллекта. Между людьми и машинами возникают разногласия, перерастающие в войну. Люди используют климатическое оружие, чтобы закрыть небо облаками и лишить роботов энергии. Роботы находят альтернативный источник питания — людей. В итоге люди проигрывают войну и становятся «живыми батарейками» в Матрице.

В эпизоде «Детская история» подросток просыпается после сверхреалистичного сна и осознаёт, что его окружающая среда — симуляция. За ним начинают охоту люди в одинаковых костюмах, и он пытается сбежать с помощью Нео. Эпизод «Программа» происходит в симуляции главной героини Сис, оформленной в средневековом японском стиле. В «Мировом рекорде» спортсмен во время важного забега перенапрягается и получает травму, но продолжает бежать, что грозит пробуждением в реальном мире. Агенты пытаются его догнать, но не могут. Дэн просыпается в капсуле, видит робота-сборщика и пересекает финиш с невероятным результатом, но травма лишает его двигательных функций. В инвалидной коляске он решает стать свободным и пытается встать на ноги. В эпизоде «По ту сторону» девушка ищет пропавшую кошку и находит дом с детьми, где искажается гравитация. Матрица замечает «ошибку рендеринга» и высылает отряд зачистки. В «Детективной истории» частный детектив Эш ищет хакера Тринити. Он попадает в поезд, где выясняется, что через него Агенты пытаются её захватить. Эш понимает, что Тринити — его шанс узнать правду, но Агенты атакуют. Тринити стреляет в него, считая, что он «не справился», но Эш хочет пойти с ней. Она исчезает, выпрыгивая из окна, а Агенты входят в вагон. В «Посвящённом» действие происходит в будущем, во время войны людей и машин. Главный персонаж — робот модели «Раннер», один из первых машин, подключённых к Матрице.