Флейта в рюкзаке: Ре

Сюжет разворачивается вокруг брата и сестры Ацуси и Ацуми, которые продолжают сталкиваться с повседневными школьными и семейными ситуациями. Одноклассница Саё узнаёт правду о возрасте брата Ацуми, что вызывает у неё внутренний конфликт, связанный с её чувствами к нему. Семья главных героев, включая родителей, отправляется на горячий источник, где все проводят время вместе.

Основное действие сосредоточено на взаимодействии персонажей в рамках их привычного окружения. Несмотря на разницу в росте между братом и сестрой, они находят способы совместно проводить дни. Сюжет строится на серии эпизодов, показывающих их повседневную жизнь, взаимоотношения с окружающими и решение возникающих бытовых и эмоциональных вопросов.